探索药物副作用预测的新前沿:多视图Kronecker正则化最小二乘融合方法

Multiple Kronecker RLS fusion-based link propagation for drug-side effect prediction

摘要

本文介绍了一种基于多视图Kronecker正则化最小二乘融合的链接传播方法(MKronRLSF-LP),用于药物副作用预测。该方法通过整合多个视角的数据,利用共识分区和多图拉普拉斯约束,提高了预测的准确性和鲁棒性。实验结果表明,MKronRLSF-LP在多个真实药物副作用数据集上表现优异,优于其他竞争方法。

原理

MKronRLSF-LP方法的核心在于扩展了Kronecker正则化最小二乘(Kron-RLS)算法,通过寻找共识分区和多图拉普拉斯约束,实现了多视图设置下的信息融合。具体来说,该方法通过生成多个分区并自适应地学习每个分区的权重,以控制其对共享分区的贡献,同时采用多图拉普拉斯正则化来增强半监督学习的表现。这种设置共同演化,以实现更好的性能。

流程

MKronRLSF-LP的工作流程包括以下步骤:

  1. 构建药物和副作用的多个基础核集。
  2. 初始化参数,包括每个视图的权重和核权重。
  3. 迭代优化过程,包括更新预测链接矩阵、权重、核权重等。
  4. 通过多图拉普拉斯正则化约束预测值,确保共识分区的鲁棒性。
  5. 最终得到药物副作用的预测模型。

应用

MKronRLSF-LP方法在药物副作用预测领域具有广泛的应用前景。由于其能够有效整合多源数据并提高预测准确性,该方法可用于药物安全性评估、药物开发和个性化医疗等领域,有助于减少药物副作用带来的风险,提高药物治疗的效率和安全性。